В старейшем и авторитетном журнале Chromosoma (Scopus/WoS, Q1) вышел обзор П.Ю.Крупина, Д.С. Ульянова, Г.И. Карлова, М.Г. Дивашука «The launch of satellite: DNA repeats as a cytogenetic tool in discovering the chromosomal universe of wild Triticeae». Этот ретроспективный обзор 240 статей отражает прогресс, достигнутый в разработке методов создания новых хромосомных маркеров пшеницы и ее дикорастущих сородичей с момента запуска этого цитогенетического инструмента в конце 1980-х годов до наших дней. ДНК-зонды, основанные на сателлитных повторах, широко используются для анализа хромосом, особенно «классические» (pSc119.2 и семейство Afa) и «универсальные» повторы (45S рДНК, 5S рДНК и микросателлиты). Быстрое развитие секвенирования нового поколения и биоинформатического анализа, а также применение меченых синтетических олиго- и мультиолигонуклеотидов привело к масштабному открытию новых хромосомных маркеров, специфичных как для геномов, так и отдельных хромосом. Благодаря современным технологиям новые хромосомные маркеры появляются с беспрецедентной скоростью. В обзоре описаны особенности локализации как широко используемых, так и недавно разработанных сателлитных повторов на хромосомах геномов J, E, V, St, Y, P дикорастущих сородичей пшеницы и их диплоидных и полиплоидных носителей Agropyron, Dasypyrum, Thinopyrum, Pseudoroegneria, Elymus, Roegneria и Kengyilia. Особое внимание уделено специфичности зондов, что определяет их применимость для выявления чужеродной интрогрессии в отдалённых гибридах пшеницы. Информация о пробах и их локализации систематизирована в базе данных TRepeT http://trepet.info/ (http://www.iab.ac.ru/), разработанной авторами статьи, и которая может быть полезна для цитогенетических исследований видов Triticeae. В обзоре описаны тенденции развития технологий, используемых для создания хромосомных маркеров, которые могут быть использованы для прогнозирования дальнейшего развития в области молекулярной биологии и в методах цитогенетического анализа.

 

Подробнее:
Kroupin Pavel Yu., Ulyanov Daniil S., Karlov Gennady I., Divashuk Mikhail G. The launch of satellite: DNA repeats as a cytogenetic tool in discovering the chromosomal universe of wild Triticeae // Chromosoma. - 2023. – DOI: 10.1007/s00412-023-00789-4